शेतात सेंद्रिय पदार्थांचे मुख्य स्त्रोत म्हणजे वनस्पतींचे कचरा (वनस्पतीची मुळे, खोड, पाने, पालापाचोळा) आणि जनावरांची खते . गांडुळे आणि सूक्ष्मजीव या पदार्थांचे विघटन करतात. विघटन प्रक्रियेमुळे पोषकद्रव्ये बाहेर पडतात जी वनस्पतींच्या मुळांद्वारे घेतली जाऊ शकतात.