पंतनाल हायलँड्समधून पाणी हळूहळू उतार असलेल्या, पंतनालच्या मोठ्या नैराश्यात वाहते. तिथून पाणी पॅराग्वे नदी आणि तिच्या उपनद्या म्हणून बाहेर पडते. अनेक नद्या आणि त्यात वाहणार्‍या पाण्याच्या साठ्यांमुळे पंतनाल एक विस्तीर्ण दलदलीचा प्रदेश बनतो..