महानगरपालिकेच्या प्रशासनाचा प्रमुख महानगरपालिका आयुक्त असतो. महानगरपालिका आयुक्त हा महानगरपालिकेच्या प्रशासनाचा प्रमुख असतो. महानगरपालिकेने घेतलेल्या सर्व निर्णयांची तो अंमलबजावणी करतो.