हरित क्रांतीचे दुष्परिणाम म्हणजे रासायनिक कीटकनाशके आणि खतांमुळे मातीची धूप आणि प्रदूषण, अनुवांशिक विविधता नष्ट होणे, गव्हाचे उत्पादन कोरड्या जागी कमी होणे आणि जास्त सिंचनामुळे लीचिंग, लॉगिंग इ.